行政合同中包括有很多的民法精神，行政合同纠纷的产生也大多包含合同的诚实信用、显失公平、不可预见、不可抗力等原因，因而行政合同发生纠纷后，双方当事人完全可以先通过协商的方法解决矛盾和纠纷，假如协商解决不了可以通过诉讼的方法维权。

行政机关不履行行政协议导致损失的解决渠道。

1、上一级行政机关的行政救济。行政合同作为一种行政行为，应受行政法所调整，对于行政合同纠纷，故救济渠道不可能排除行政救济即行政复议。国内行政复议法第2条规定：“公民、法人或者其他组织觉得具体行政行为侵犯其合法权益，向行政机关提出行政复议申请，行政机关受理行政复议申请，作出行政复议决定，适用本法。”第6条对行政复议范围作了明确的规定，其中第五款“觉得行政机关侵犯合法的经营自主经营权的”，第六款“觉得行政机关变更或者废止农业承包合同，侵犯其合法权益的”，是将纳入行政复议范围的行政合同具体化了。所以相对人也可以通过行政复议来解决发生的行政合同纠纷。

2、提交法院的司法救济。行政主体在行政合同中处于优越的地位，而行政管理的相对人就成了弱势群体。所以司法救济是保护他们合法权益的效果最好也是最后的渠道。现在，行政合同纠纷在司法审判中，在审理程序法上适用民事诉讼程序，在实体判决上适用民事法律规范和行政法律规范的法律适用模式。在具体操作中，总是依据原告的诉讼请求，来适用民事或行政诉讼程序。

日常，建议可以先到有关的行政机关知道了解是何原故未能履行协议，协商不成的，又期望行政机关赔偿的，建议可以找个不履行行政协议专业的律师帮忙核算有关的损失，必要时可直接聘请律师代理诉讼。